Đức Cha Phêrô Nguyễn Văn Khảm sinh ngày 02.10.1952 tại Đàn Giản, Hà Đông (nay thuộc Hà Nội).
1963 – 1972: Học tại Tiểu chủng viện Thánh Quý, Cái Răng, Cần Thơ.
1973 – 1976: Học tại Đại chủng viện Thánh Tôma, Long Xuyên.
1977 – 1979: Học tại Đại chủng viện Thánh Giuse TP. HCM.
30.08.1980: Thụ phong linh mục.
1980 – 1983: Linh mục phụ tá Giáo xứ Hà Đông, hạt Xóm Mới.
1983 – 1987: Quản nhiệm Giáo xứ Hà Nội, hạt Xóm Mới.
1987 – 1999: Linh mục phụ tá Nhà thờ Chính toà Tổng giáo phận TP. HCM.
1997: Giáo sư Đại chủng viện Thánh Giuse TP. HCM.
2001 – 2004: Học Thần học Mục vụ tại Đại học Công giáo Hoa Kỳ, tốt nghiệp tiến sĩ.
2004 – 10.2012: Giám đốc Trung tâm Mục vụ Tổng giáo phận TP. HCM.
Tháng 03.2008: Thư ký điều hành của Hội đồng Giám mục Việt Nam.
15.10.2008: được Đức Thánh Cha Bênêđictô XVI bổ nhiệm làm Giám mục Phụ tá Tổng giáo phận TP. Hồ Chí Minh – Châm ngôn Giám mục: “Hãy theo Thầy”.
15.11.2008: Thánh lễ tấn phong Giám mục tại Đại chủng viện Thánh Giuse TP. HCM, do Đức hồng y Gioan Baotixita Phạm Minh Mẫn chủ phong.
6.2011 – 19.03.2012: Giám đốc Đại chủng viện Thánh Giuse TP. HCM.
Ngày 26.07.2014: được Đức Thánh Cha Phanxicô bổ nhiệm làm Giám mục Giáo phận Mỹ Tho.
Ngày 30.08.2014: Đức Cha về Giáo phận Mỹ Tho.
Trong Hội đồng Giám mục Việt Nam, Đức cha Phêrô Nguyễn Văn Khảm đã đảm nhiệm các chức vụ: Chủ tịch Uỷ ban Giáo dục Công giáo (2009–2010), Chủ tịch Uỷ ban Truyền thông Xã hội (nhiệm kỳ 2010–2013), Phó Tổng Thư ký (nhiệm kỳ 2010–2013 và 2013–2016).